1947년 덴마크 코펜하겐 출생. 라스 폰 트리에, 토마스 빈터베르그 등과 더불어 아방가르드 영화운동인 도그마 선언에 참여한 인물.
그는 처음에는 대중음악가로 출발하였다. 고국을 떠나 체코 프라하의 FAMU에서 영화수업을 받은 그는 졸업 후 덴마크로 돌아와 라디오와 TV 그리고 상업 광고 분야를 오가며 연출활동을 했으며 1978년 드라마 [나의 아름다운 배꼽을 보고싶어?]로 장편데뷔 했다.
데뷔 이후 꾸준한 작품활동으로 덴마크 영화계에서 나름의 입지를 구축해온 야콥센은 1997년 완성한 전쟁드라마 [The Island in Bird Street]로 베를린 영화제 금곰상 후보에 오르는 등 호평을 받았으며, 1999년 도그마 선언의 세번째 작품인 [미후네]로 베를린 영화제 은곰상을 수상, 국제무대에 자신의 존재를 새롭게 각인시켰다.